Ertesi gün hapları hormon içeren ilaçlardır.Bu sebeple de çeşitli yan etkileri vardır. Ancak bu yan etkiler kalıcı yan etkiler değildir. Doğum kontrol haplarının en yaygın yan etkisi, bulantı ve kusmadır. Bu özellikle östrojen ve progesteron hormonunu ihtiva eden ertesi gün haplarında daha fazla görülür.
Yalnızca progesteron ihtiva eden haplar bu açıdan daha avantajlıdır. Bulantı ve kusma gibi yan etkilerle karşılaşılmaz.
Ertesi gün haplarının diğer yan etkileri ise:

• adet gecikmesi,
• lekelenme,
• damla şeklinde kanama ,
• adet miktarında azalma,
• adet düzensizlikleri olarak sayılabilir.

Bu etkiler yalnızca hapın alındığı ay ortaya çıkar. Geçici yan etkilerdir. Sonraki aylarda adet düzeni eskisine dönecektir. Ancak bu noktada dikkat edilmesi gereken, ertesi gün haplarının sık sık kullanılmaması gerektiğidir. Bunun dışında görülen yan etkiler doğrudan ertesi gün haplarına bağlanmamalıdır. Adet gecikmesi gibi yan etkiler, gebelikten dolayı olabilir. Bu sebeple adet gecikirse, zaman kaybetmeden gebelik testi yapılması gerekir.

Diğer hormon ihtiva eden ilaçlarda olduğu gibi:

• Memelerde dolgunluk,
• Memelerde şişme,
• Memelerde hassasiyet,
• Baş ağrısı gibi yan etkiler de meydana gelebilir.

Doğum kontrol haplarının yan etkilerinden en yaygın olarak karşılaşılanı baş ağrısı ve migrendir. Ertesi gün hapı kullanan kişilerde, gözlerde ışığa karşı hassasiyet ve sese karşı duyarlılık meydana gelir. Bunun dışında şiddetli karın ağrısı, mide bulantısı ve kusma da görülebilir.
Ertesi gün haplarının diğer yan etkileri gözlerde ortaya çıkabilir. Kontak lens kullanan kişilerde kornea hassasiyeti ve kornea ağrısı en belirgin özelliklerin biri olarak meydana gelir. Bunun dışında karaciğeri sağlıklı olmayan kadınlarda sarılık belirtileri meydana gelebilir. Bunun dışında yüksek tansiyon ve taşikardi durumları görülebilir.
Ertesi gün hapları hormonal tepkime ile etkili olan bir ilaçtır. Bu sebeple de ertesi gün hapı içen insanların büyük bölümünde ara kanama meydana gelebilir. Bunun dışında serviks salgısında değişim ve vajinal enfeksiyon belirtileri de gözlemlenir. Bunlar ertesi gün haplarının gözlemlenebilen yan etkileridir.
Ertesi gün hapı kullanımında, dilde ve dudaklarda şişme meydana gelirse, nefes alma güçlüğü ortaya çıkarsa deri döküntüleri ve kaşıntı gibi ciddi yan etkiler meydana gelirse, hemen ilaç kullanımı durdurulmalıdır. Zaman kaybetmeden en yakın sağlık kurumuna gitmek gerekir.
Bunların dışında ertesi gün hapları doğum kontrol yöntemleri değildir. Bu sebeple de sık sık kullanımı doğru değildir. İlaç ile korunma sağlanacak ise, doğum kontrol hapları tercih edilmelidir.